CEL - Affymetrix Probe Results File

What is a CEL file

Affimetrix разработала программу анализа снимков ДНК, которая использует файлы в формате CEL. Такой файл содержит все типы данных, которые получены с датчиков. Эти данные хранятся в GeneChip, который может содержать большое количество различных данных. Таким образом, файлы CEL обычно имеют довольно большой размер. Файлы CEL можно использовать для создания двумерной сетки или изображения генома после анализа и визуализации данных внутри файла.

Обычно в каждом эксперименте используется один GeneChip. Они созданы из силикона или стекла и содержат датчик. Данные, полученные с помощью таких датчиков, которые содержат схожие и несопоставимые значения, сохраняются в формате файла CEL. Они, в частности, используются при исследовании заболеваний как у животных, так и у людей, поскольку такие данные могут показать изменения в ДНК задействованного датчика. Файлы CEL сохраняются как в двоичном формате, так и в формате ASCII (в зависимости от версии файла). Кроме того, файл CEL может использоваться только с соответствующим файлом CDF. В файле CDF хранится словарь, относящийся к данным датчика файла CEL.

Here's a small, but not exhaustive list of programs that can open CEL documents:

  • Affymetrix Tiling Analysis Software (Windows)
  • dChip (Windows)
  • multi-aff-py (Windows, Mac & Linux)
  • RMAExpress (Windows)
  • The MathWorks MATLAB (Windows)
  • VSN GenStat (Windows)
О нас
Расширение CEL
Полезные ссылки