Was ist eine CEL Datei
Affimetrix enwickelte ein DNA-Bild-Analyse-Programm, welches sogenannte CEL Dateien verwendet. Die Datei beinhaltet ale Arten von Daten, welche Proben entnommen wurden. Diese Daten werden auf einem speziellen GeneChip gespeichert, welcher eine große Anzahl an unterschiedlichen Daten enthalten kann. Daher haben CEL Dateien üblicherweise eine große Dateigröße. Die CEL Dateien können dazu verwendet werden, um ein 2D-Gitter oder eine Grafik von einem Genom herzustellen, nachdem die Daten in der Datei analysiert und visualisiert wurden.
Üblicherweise wird ein GeneChip pro Experiment verwendet. Sie werden aus Silikon oder Glass hergestellt und enthalten die Probe. Die Daten, in Bezug auf übereinstimmende und nicht-übereinstimmende Werte, die in dieser Probe gefunden wurden, werden im CEL Dateiformat gespeichert. Sie werden besonders in der Erforschung von Krankheiten bei Tieren und Menschen verwendet, da die Daten Veränderungen in der DNA der erfassten Probe anzeigen. CEL Dateien werden sowohl in einem binären als auch im ASCII-Format gespeichert, je nach Version der Datei. Des Weiteren kann eine CEL Datei nur mit der entsprechenden CDF Datei verwendet werden. Die CDF Datei enthält ein Wörterbuch, welches speziell für die Daten der Probe in der CEL Datei erstellt wurde.
Hier ist eine kleine aber nicht vollständige Liste von Programmen, die CEL Dokumente öffnen können:
- Affymetrix Tiling Analysis Software (Windows)
- dChip (Windows)
- multi-aff-py (Windows, Mac & Linux)
- RMAExpress (Windows)
- The MathWorks MATLAB (Windows)
- VSN GenStat (Windows)
