CEL - Affymetrix Probe Results File

What is a CEL file

Affimetrix desarrolló un programa de análisis de imágenes de ADN que utiliza archivos CEL. Estos archivos contienen todo tipo de datos recopilados de distintas muestras. Estos datos se almacenan en un GeneChip que puede contener numerosos datos diferentes. Por tanto, los archivos CEL normalmente tienen un tamaño considerable. Los archivos CEL pueden utilizarse para generar una gráfica o cuadrícula en 2D de un genoma después de analizar y visualizar los datos contenidos en ellos.

Normalmente se utiliza un GeneChip por experimento. Se genera a partir de silicona o vidrio y contiene la muestra. Los datos contenidos en estas muestras relacionados con valores concordantes y discordantes se almacenan con el formato de archivo CEL. Se utilizan especialmente en la investigación de enfermedades tanto en animales como en humanos, pues los datos pueden mostrar alteraciones en el ADN de la muestra tomada. Los archivos CEL se guardan en formato binario y en ASCII, según la versión del archivo. Es más, un archivo CEL solo puede utilizarse con su respectivo archivo CDF. El archivo CDF almacena un diccionario concreto para los datos de la muestra contenidos en el archivo CEL.

Here's a small, but not exhaustive list of programs that can open CEL documents:

  • Affymetrix Tiling Analysis Software (Windows)
  • dChip (Windows)
  • multi-aff-py (Windows, Mac & Linux)
  • RMAExpress (Windows)
  • The MathWorks MATLAB (Windows)
  • VSN GenStat (Windows)
Sobre
Extensión CEL
Enlaces prácticos